微生物采样器可广泛地用于卫生防疫、生物洁净、制药、发酵工业等环境中的监测以及有关研究教学部门作空气微生物的采样研究，为评价空气环境微生物污染危害及其防治措施提供依据。
微生物采样器除了能够测定空气微生物的数量之外，它特性还能测出这些粒子的大小，而后者是判定空气微生物危害的重要指标之一。它是由六个撞击器组合成一体，每级实际是一个单级采样器，利用6次反复撞击原理，绝大部分粒子特别是在气管及肺沉降的粒子基本都撞击下来，因而它采集到的粒子大小范围自然比单级的广，这是一些单级撞击采样器所不能比较的，而且采样器的圆形喷口比裂隙等喷口有更高的采样效率。采样时相对湿度逐级地增高（由1级的39%增至第六级的88%），这十分有利于脆弱的病原微生物，特别是病毒粒子的存活。由于它这些与众不同的特点，使它广泛而有效地应用于空气微生物的监测，自问世以来常用不衰。微生物采样器模拟人呼吸道的解剖结构和空气动力学生理特征，采样惯性撞击原理而将悬浮在空气中的微生物粒子分等级地收集到采样介质表面上，然后供培养及微生物学分析。
微生物采样器的空气采样管道可以根据保护区域或对象灵活匹配，保证更好的火灾探测效果。典型的采样管道布置在天花板下方，采样孔开在适当的位置，这样空气样本就可通过采样孔和管道送回检测主机。当空调或机械通风系统在保护区内运行时，可能会影响火灾产生的烟气流向，也可以在烟气可能的行进方向设置采样管道，采集含有火灾烟气的空气样本。当可能的火源被保护在封闭的空间内时，可以使用分支取样软管将取样孔延伸到空间内，并将空气样品泵回检测主机进行检测。
