磁扇电子轰击质谱仪是分离和检测不同同位素的仪器，磁扇电子轰击质谱仪的应用范围非常广泛的，在很多领域当中都有一定的应用。用户如果要使用磁扇电子轰击质谱仪就要了解质谱仪的工作原理是什么：
磁扇电子轰击质谱仪的工作原理是以电子轰击或其他的方式使被测物质离子化，形成各种质荷比(m/e)的离子，然后利用电磁学原理使离子按不同的质荷比分离并测量各种离子的强度，从而确定被测物质的分子量和结构。
仪器的主要装置放在真空中。将物质气化、电离成离子束，经电压加速和聚焦，然后通过磁场电场区，不同质量的离子受到磁场电场的偏转不同，聚焦在不同的位置，从而获得不同同位素的质量谱。质谱方法zui早于1913年由J.J.汤姆孙确定，以后经F.W.阿斯顿等人改进*。现代质谱仪经过不断改进，仍然利用电磁学原理，使离子束按荷质比分离。磁扇电子轰击质谱仪的性能指标是它的分辨率，如果质谱仪恰能分辨质量m和m＋Δm，分辨率定义为m／Δm。现代质谱仪的分辨率达105～106量级，可测量原子质量到小数点后7位数字。
磁扇电子轰击质谱仪zui重要的应用是分离同位素并测定它们的原子质量及相对丰度。测定原子质量的精度超过化学测量方法，大约2／3以上的原子的质量是用质谱方法测定的。由于质量和能量的当量关系，由此可得到有关核结构与核结合能的知识。对于可通过矿石中提取的放射性衰变产物元素的分析测量，可确定矿石的地质年代。质谱方法还可用于有机化学分析，特别是微量杂质分析，测量分子的分子量，为确定化合物的分子式和分子结构提供可靠的依据。由于化合物有着像指纹一样的质谱，磁扇电子轰击质谱仪在工业生产中也得到广泛应用。
