水果加工生产线需要根据具体果蔬要求进行：分拣、清洗、去皮、去核、分切、护色、清洗、沥干、速冻、真空冷冻干燥、分拣、称重包装、检测、打包等工艺流程，分三个区域冻干前处理区域、冻干加工区域、冻干后处理区域进行设计布局。
水果加工生产线的工厂装修根据食品安全要求满足GMP标准，成套设备材质要在304或者316不锈钢材质。在设计和布局时需要根据处理量要求匹配设备大小，进行合理分布设计。
果蔬在采收、分级、包装、运输和贮藏过程中会遇到挤压、碰撞、刺扎等损伤。在这种情况下，果蔬的呼吸强度增强，因而会大大缩短贮藏寿命，加速果蔬的后熟和衰老。受机械损伤的果蔬，还容易受病菌侵染而引起腐烂。
净菜又称切割果蔬、半处理加工果蔬或小果蔬，是新兴的食品加工产品，具有安全、新鲜和营养等特征。净菜处理的工程包含蔬菜浸泡、人工或流水线机械清洗、切菜（超重、或不规则蔬菜进行切割）流水线风干等工序。
因此，净菜保鲜难度比一般原始（未经处理的）蔬菜高，其保鲜期也大大缩短。如何做好净菜的包装保鲜工作，是发展净菜行业的重要前提。
在国内多数净菜使用氯制剂（次氯酸钠等）或臭氧水消毒杀菌，但有其一定的缺陷。氯制剂有刺激性气味和毒性，消毒后需要用清水多次冲洗，会浪费大量的冲洗水，而且清水不是无菌水，冲洗会造成二次污染。
臭氧水杀菌具有一定优势，但其具有神经毒性，在水中的溶解度有限，臭氧水洗菜的杀菌效力有限，从水中游离出的臭氧吸入后对人体有较大的危害，臭氧容易导致超标。
