有机肥发酵能快速分解有机质，同时强力降解蛋白质、发酵时间短，能有效杀死发酵物中的有害菌、虫、虫卵、草籽等。堆肥是常见的有机肥发酵方式，实际上，有机肥发酵是分为几个阶段的，包括发热阶段、高温阶段、降温阶段和腐熟保肥阶段，在发热阶段，堆肥中的微生物产生大量的热，不断提高堆肥温度，从20度左右上升至40度，接着进入高温阶段，在高温阶段中，好热菌为主要种类，其对有机肥中的有机物进行分解并产生热量堆积，温度在65度左右，一段时间后进入降温阶段，当高温持续一段时间后，其中的微生物活动微弱，降至40度以下，如果降温过早，其中植物性物质分解不充分，在腐熟保肥阶段，堆肥温度降至气温左右。

　　生物有机肥滚筒发酵设备能够在物料发酵过程中对物料进行充分搅拌，加速其与空气接触，保证发酵反应充分，以圆柱体滚筒作为发酵设备主体，运行时，堆肥物料在滚筒内部通过滚筒的机械运动被反复搅拌、 翻抛，使物料得到充分的混匀。 除滚筒主体部分外， 滚筒式堆肥反应器统还包括通风系统和尾气处理装置等。 滚筒反应器的堆肥周期只有4-7天，能快速的完成整个堆肥过程。滚筒倾斜放置，物料因重力作用沿旋转方向聚集， 同时逐渐向筒体出口端移动。滚筒用5cm厚的黑色橡塑隔热海绵进行全身包裹作为保温层，再用铝皮包裹保温层，保暖效果好。动力根据规格采用电机，能耗消耗小，用电量省。

　　好氧发酵制作堆肥，可以保证产生足够的高温，杀死其中的寄生虫及卵，以及杀死病菌营养体细胞，杀死杂草种子，以及尽量消耗掉物料中的能量如碳水化合物，以免将来施用到土壤中后，会造成烧根等不良现象，同时高温才有条件尽量消耗掉秸秆中的碳氢化合物，如果不把秸秆中的碳氢化合物除去，则将来把这种肥料施到土壤中后，一是会烧根，二是因为这种肥碳氮比太高，会造成微生物大量发热的同时，会争夺土壤中的氮源来平衡碳氮比，这样就造成与植物争肥的不良好局面，造成植物根苗细长不壮实；同时，好氧发酵可以保证快速发酵，保持农民在两茬作物之间的短暂的时间内，充分完成秸秆的腐熟过程。